In einer zweiten Förderphase plant das BMBF die Einrichtung von weiteren fünf Deutschen Forschungslehrstühlen an AIMS-Zentren. Die Auswahl und Betreuung der Forschungslehrstühle erfolgt über die AvH. Über den DAAD werden Begleitmaßnahmen gefördert. Diese umfassen Aktivitäten, welche im Rahmen von Hochschulkooperationen durchgeführt werden (u.a. Studien-, Lehr- und Forschungsaufenthalte, Teilnahme und Durchführung von Veranstaltungen, Fachkongressen, Entwicklung und Umsetzung digitaler Formate). Zum anderen umfassen sie die Vergabe von Stipendien für Doktoranden und Postdocs sowie einen Beitrag zur Förderung der Human Ressources der AIMS-Administration.